26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1358 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0990  FmdB family regulatory protein  94 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1169  hypothetical protein  89 
 
 		 114 aa  190  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  48.78 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0665  FmdB family regulatory protein  32.58 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000563996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  43.75 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  41.46 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  30.49 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  41.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1544  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00857595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  36.23 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0734  hypothetical protein  29.55 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000750313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  43.9 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  30.77 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  31.25 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  38.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  37.04 
 
 		 68 aa  40  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 		 99 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  37.78 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>