48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_11 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_11  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0012  hypothetical protein  93.55 
 
 		 62 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0011  hypothetical protein  90.32 
 
 		 62 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1622  hypothetical protein  45.9 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.728962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4938  protein of unknown function DUF951  44.26 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1335  hypothetical protein  45.9 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2512  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.492009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1698  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.232742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2979  hypothetical protein  50.94 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2657  hypothetical protein  50.94 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000585923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1012  protein of unknown function DUF951  43.64 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4356  protein of unknown function DUF951  43.33 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2918  protein of unknown function DUF951  42.86 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0583199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1277  protein of unknown function DUF951  55.1 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3354  protein of unknown function DUF951  43.4 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2395  hypothetical protein  43.33 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3309  hypothetical protein  53.85 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00365969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2934  protein of unknown function DUF951  40 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.729107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3420  protein of unknown function DUF951  45.45 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000722582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3549  protein of unknown function DUF951  45.45 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1740  hypothetical protein  44.23 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00369112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5627  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5586  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000749873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5725  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0711211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5329  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5157  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5173  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23380  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000231941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5603  hypothetical protein  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299214  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0108  hypothetical protein  35.48 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00050244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3775  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000925951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5269  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.811268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2219  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2541  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000101781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4016  hypothetical protein  38.18 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5332  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00306905  hitchhiker  0.000000716773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0421  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0303316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0410  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0040  hypothetical protein  35.85 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0833  protein of unknown function DUF951  43.4 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0116  hypothetical protein  37.74 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0967393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0126  hypothetical protein  38.78 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000245604  normal  0.804056 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0004  hypothetical protein  35.71 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0935522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2139  protein of unknown function DUF951  38.3 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213979  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0208  protein of unknown function DUF951  37.21 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.98108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>