228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1099 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  95.71 
 
 		 163 aa  319  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  95.09 
 
 		 163 aa  313  7e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  39.51 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40.74 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  37.04 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  42.94 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  38.51 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  39.26 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  36.42 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  35.62 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  36.25 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  38.65 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.49 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  37.8 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  33.95 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  33.95 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  34.38 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  35.37 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  37.42 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  35 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  35.58 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  33.95 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>