61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1080 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  93.4 
 
 		 106 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  54.17 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  52.43 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  51.43 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  54.08 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  54.08 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2436  hypothetical protein  46.23 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000881987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  56.7 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  52.53 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  52.53 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  51.52 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  45.83 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  46.3 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  42.19 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  36.5 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  44.64 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1432  hypothetical protein  52.73 
 
 		 58 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.205478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000124121  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000122537  unclonable  0.00000659676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1256  hypothetical protein  52.08 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000019657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1068  hypothetical protein  52.08 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000000882951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0078  hypothetical protein  46.77 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000380908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0627  hypothetical protein  51.06 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.236913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0613  hypothetical protein  51.06 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2926  hypothetical protein  46.94 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  44.62 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0467  hypothetical protein  51.06 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000182221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2057  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.32922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32335  predicted protein  46.94 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00362382  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2664  hypothetical protein  46.15 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0747  hypothetical protein  46.81 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0273409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0762  hypothetical protein  46.81 
 
 		 51 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  55.32 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  47.06 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0033  hypothetical protein  48 
 
 		 55 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0232  hypothetical protein  46 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.939716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  53.66 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0190  hypothetical protein  43.1 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0593  hypothetical protein  43.4 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  45.83 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  51.06 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0657  hypothetical protein  48.78 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2425  hypothetical protein  42.59 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.989254  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0656  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  47.5 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  48.72 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  47.5 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1492  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.293244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>