62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1057 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000225436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1274  hypothetical protein  93.53 
 
 		 147 aa  273  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000334048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1085  metal-binding protein  89.93 
 
 		 147 aa  262  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0742  hypothetical protein  39.01 
 
 		 178 aa  106  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  37.06 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  34.97 
 
 		 182 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  32.17 
 
 		 186 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2989  protein of unknown function DUF177  31.16 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000169485  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  28.44 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  35.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  29.93 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  28.89 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  32.04 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  31.43 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  26.42 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  27.45 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  26.42 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  28.17 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000607383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7997  metal-binding possibly nucleic acid-binding protein-like protein  28 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0649  hypothetical protein  30.43 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.865201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  26.39 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  27 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  28.16 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  25.81 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  27.52 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  26.76 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1136  hypothetical protein  27.47 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103256  normal  0.0238581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  23.3 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1668  protein of unknown function DUF177  28.67 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.323385  normal  0.0100711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  29.35 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  27.59 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000453474  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  28.3 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  23.29 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  29.67 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0339  hypothetical protein  30.43 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.834637  normal  0.0667006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  26.52 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  28.97 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  25.36 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  26.37 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  30.19 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2275  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  26.17 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  25.76 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  25.76 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  29.25 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  26.77 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  21 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  27.52 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4193  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  26.96 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  29.57 
 
 		 178 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  26.61 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1512  protein of unknown function DUF177  32.41 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3604  hypothetical protein  27.17 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  26.37 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11270  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  27.52 
 
 		 191 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  27.78 
 
 		 167 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>