98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1046 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1263  DAK2 domain-containing protein  96.88 
 
 
544 aa  1083    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000174743  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1074  Dak phosphatase  95.96 
 
 
544 aa  1071    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394309  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1046  DAK2 domain protein  100 
 
 
544 aa  1115    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000946454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0365  Dak phosphatase  41.02 
 
 
545 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0753407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10100  Dak phosphatase  43.14 
 
 
549 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1108  Dak phosphatase  41.33 
 
 
530 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.190449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3837  Dak phosphatase  40.61 
 
 
560 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000220177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1652  Dak phosphatase  37.69 
 
 
545 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1703  DAK2 domain-containing protein  39.14 
 
 
548 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1985  DAK2 domain-containing protein  38.87 
 
 
548 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1271  Dak phosphatase  41.1 
 
 
537 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1964  DAK2 domain fusion protein YloV  40.4 
 
 
556 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1345  Dak phosphatase  40.5 
 
 
554 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.472978  normal  0.102609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0759  hypothetical protein  40.48 
 
 
546 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1139  Dak phosphatase  40.89 
 
 
544 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000146638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1285  hypothetical protein  38.57 
 
 
548 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00246174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1310  hypothetical protein  38.57 
 
 
548 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.031715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1074  Dak phosphatase  40.04 
 
 
558 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0587558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0770  dihydroxyacetone kinase-like protein  39.86 
 
 
554 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000515154  hitchhiker  0.00000000543128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1742  Dak phosphatase  39.26 
 
 
533 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000219907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0792  DAK2 domain-containing protein  38.48 
 
 
552 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2508  Dak phosphatase  38.3 
 
 
558 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000248731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1288  putative phosphatase  37.83 
 
 
558 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156149  hitchhiker  0.000000536799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3955  putative phosphatase  37.83 
 
 
558 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00126746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3615  dihydroxyacetone-related kinase  37.65 
 
 
558 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00834771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3707  phosphatase  37.48 
 
 
558 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0785111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3597  dihydroxyacetone-related kinase  37.48 
 
 
558 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00426052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3994  phosphatase  37.48 
 
 
558 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000202396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3904  putative phosphatase  37.48 
 
 
558 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000520066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1697  DAK2 domain fusion protein YloV  38.96 
 
 
518 aa  359  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3870  putative phosphatase  37.48 
 
 
558 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5430699999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3679  Dak phosphatase  38.1 
 
 
558 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.006144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3898  phosphatase, putative  37.48 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2785  Dak phosphatase  37.5 
 
 
532 aa  356  7.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0307198  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1854  hypothetical protein  37.77 
 
 
555 aa  353  5e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0740744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2891  Dak phosphatase  37.94 
 
 
560 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000066683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0131  DAK2 domain-containing protein  37.79 
 
 
543 aa  348  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0448  dihydroxyacetone kinase-like protein  36.19 
 
 
554 aa  346  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0178919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0196  dihydroxyacetone kinase-like protein  38.37 
 
 
554 aa  346  6e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0179042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1504  dihydroxyacetone kinase-like protein  36.9 
 
 
568 aa  345  1e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1722  Dak phosphatase  38.83 
 
 
538 aa  343  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0961708  normal  0.0612757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1223  Dak phosphatase  36.43 
 
 
546 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1515  Dak phosphatase  37.75 
 
 
537 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf741  predicted kinase, related to dihydroxyacetone kinase  36.58 
 
 
546 aa  331  2e-89  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0490  dihydroxyacetone kinase 2 domain-containing protein  36.64 
 
 
547 aa  331  2e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2995  DAK2 domain fusion protein YloV  37 
 
 
533 aa  329  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0250  Dak phosphatase  36.33 
 
 
537 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1163  Dak phosphatase  35.33 
 
 
569 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1369  Dak phosphatase  37.09 
 
 
526 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0730023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1060  Dak phosphatase  35.3 
 
 
528 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1052  Dak phosphatase  35.3 
 
 
528 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1353  Dak phosphatase  36.08 
 
 
544 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000477806  normal  0.2025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1040  Dak phosphatase  35.05 
 
 
522 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0861  Dak phosphatase  36.26 
 
 
554 aa  296  5e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00152626  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1090  Dak phosphatase  35.57 
 
 
555 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl229  dihydroxyacetone kinase  33.75 
 
 
548 aa  292  9e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.292481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09990  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  36.01 
 
 
543 aa  289  8e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000203822  hitchhiker  0.00000373427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3521  Dak phosphatase  31.94 
 
 
517 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400174  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  33.94 
 
 
833 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0604  Dak phosphatase  33.52 
 
 
516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00036597  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1430  degV family protein  33.93 
 
 
827 aa  274  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05580  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  34.64 
 
 
543 aa  270  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.673773  normal  0.766108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3703  DAK2 domain fusion protein YloV  31.71 
 
 
560 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1517  Dak phosphatase  30.38 
 
 
539 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0198  DAK2 domain protein  30.05 
 
 
564 aa  229  7e-59  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3286  Dak phosphatase  31.96 
 
 
552 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  39.12 
 
 
637 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  37.89 
 
 
604 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1278  Dak phosphatase  28.93 
 
 
541 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4036  DAK2 domain fusion protein YloV  30.26 
 
 
542 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1168  Dak phosphatase  28.93 
 
 
541 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0701112  hitchhiker  0.00000069838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8001  hypothetical protein  30.13 
 
 
521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2115  Dak phosphatase  29.47 
 
 
545 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  36.42 
 
 
683 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3201  DAK2 domain fusion protein YloV  30.37 
 
 
548 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8026  Dak phosphatase  26.75 
 
 
601 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5978  Dak phosphatase  28.55 
 
 
545 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2834  Dak phosphatase  26.9 
 
 
545 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0263  hypothetical protein  28.25 
 
 
595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0258  hypothetical protein  27.92 
 
 
595 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10810  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  25.04 
 
 
566 aa  124  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.112776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2154  Dak phosphatase  27.22 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1915  Dak phosphatase  28.68 
 
 
547 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.800131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1981  Dak phosphatase  28.95 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.169547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1935  Dak phosphatase  28.95 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12989  hypothetical protein  26.44 
 
 
470 aa  107  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11210  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  26.38 
 
 
580 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0863613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4213  Dak phosphatase  27.8 
 
 
547 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554273  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09230  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  24.51 
 
 
554 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0794295  normal  0.708422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2248  Dak phosphatase  29.36 
 
 
341 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000936614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2511  Dak phosphatase  28.1 
 
 
344 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1675  Dak phosphatase  28.39 
 
 
512 aa  87.4  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000383115  hitchhiker  0.00671011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1581  Dak phosphatase  29.33 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.659645  normal  0.0872283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08820  predicted kinase, dihydroxyacetone kinase  34.83 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2280  Dak phosphatase  34.33 
 
 
553 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2305  Dak phosphatase  34.41 
 
 
485 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188446  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1340  hypothetical protein  39.19 
 
 
83 aa  60.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000654489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0194  hypothetical protein  35.53 
 
 
86 aa  57  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>