108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1000 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1000  cobalt transport protein  100 
 
 
260 aa  507  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  32.58 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  32.4 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  32 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  32 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  32 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  32 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  32.93 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  32 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  32 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  32 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  32.53 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  32.6 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  32.1 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  30.77 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.95 
 
 
268 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  32.88 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  31.5 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  31.5 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.41 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  30 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  30.74 
 
 
267 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  28.63 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.16 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  32.61 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  27.78 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  30.08 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  29.84 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  31.36 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.66 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  30.56 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  29.31 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  29.69 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.6 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  26.99 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.15 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.24 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  29.65 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  27.69 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  28.57 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.78 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  27.11 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  28.81 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  28.35 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.27 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.63 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.59 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28 
 
 
810 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.02 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.64 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.64 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  30.71 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  31.91 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  27.83 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.59 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  26.88 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  29.09 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  27.84 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  27.07 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  28.39 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  24.37 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  26.45 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  21.82 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.03 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  29.49 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.62 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.51 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  24.22 
 
 
255 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  30.09 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  35.43 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  32.65 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  25.75 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.25 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  30.16 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  25.28 
 
 
290 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  24.77 
 
 
200 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  25.28 
 
 
290 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
770 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.38 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  37.33 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  28.45 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  28.57 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  22.88 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  28.57 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  29.37 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2731  cobalt transport protein  29.41 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  33.03 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  30.84 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  33.66 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  22.8 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  35.64 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3318  ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.427182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>