61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0281 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  203  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  73.47 
 
 
101 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  69.7 
 
 
99 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  65.69 
 
 
102 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  65.66 
 
 
98 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  68.09 
 
 
96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  62.5 
 
 
105 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  60.42 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  58.51 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  60.87 
 
 
97 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  53.51 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  48.78 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  53.76 
 
 
95 aa  114  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  52.69 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  52.69 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  47.58 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  49.12 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  53.76 
 
 
106 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2436  hypothetical protein  50.51 
 
 
112 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000881987  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  46.61 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  53.61 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  53.61 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  51.61 
 
 
96 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  53.06 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  39.1 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1432  hypothetical protein  61.4 
 
 
58 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.205478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0078  hypothetical protein  63.33 
 
 
68 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000380908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0747  hypothetical protein  73.33 
 
 
51 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0273409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0762  hypothetical protein  73.33 
 
 
51 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0467  hypothetical protein  63.27 
 
 
77 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000182221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.39 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000122537  unclonable  0.00000659676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2926  hypothetical protein  65.96 
 
 
52 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2664  hypothetical protein  59.62 
 
 
62 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.04 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000124121  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0627  hypothetical protein  62.5 
 
 
51 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.236913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0613  hypothetical protein  62.5 
 
 
51 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32335  predicted protein  53.19 
 
 
234 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00362382  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1256  hypothetical protein  57.78 
 
 
51 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000019657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1068  hypothetical protein  57.78 
 
 
51 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000000882951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2057  hypothetical protein  51.02 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.32922  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  52.08 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  37.36 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  46.51 
 
 
55 aa  53.9  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0657  hypothetical protein  52.27 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  46 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  52.38 
 
 
64 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  38.98 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  52.5 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  57.58 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0656  hypothetical protein  46.94 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  54.55 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0190  hypothetical protein  39.66 
 
 
60 aa  47.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341915  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0593  hypothetical protein  45.45 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  54.55 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0033  hypothetical protein  45.65 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1492  hypothetical protein  42.11 
 
 
336 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0232  hypothetical protein  40.38 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.939716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2425  hypothetical protein  47.37 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.989254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>