More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2445 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.763703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  60.38 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6125  integrase catalytic region  63.46 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0761  integrase catalytic subunit  55.77 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4686  Integrase catalytic region  54.72 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1942  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2682  hypothetical protein  59.52 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0546  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1790  hypothetical protein  49.02 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35129  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  42.31 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3040  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0034  bacteriophage/transposase fusion protein  49.02 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00236951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  50.98 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  50 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  47.06 
 
 		 286 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  48.08 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.15 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3560  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  42.19 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.19 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  45.28 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0475  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.19 
 
 		 379 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  42.19 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1914  IS5 family transposase orfB  47.06 
 
 		 76 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.346093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  42.19 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  42.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  42.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  42.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  42.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  42.19 
 
 		 272 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3686  Integrase catalytic region  47.17 
 
 		 296 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal  0.0371116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  47.17 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  45.28 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  45.28 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.28 
 
 		 286 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  47.06 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  49.02 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  47.06 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  47.06 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  47.06 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>