More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2429 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2429  ABC transporter-like  100 
 
 		 74 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.15 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.15 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.15 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.46 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  49.12 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  47.46 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  47.76 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2845  ABC transporter related  45.61 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000305436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  50 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  47.69 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  52.54 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.76 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  50.94 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  43.86 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  43.86 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  53.23 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  46.27 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0440  ABC transporter related  45.68 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  55.56 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  49.15 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  43.24 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  54.72 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  41.89 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  45.76 
 
 		 275 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  46.55 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  51.79 
 
 		 330 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 255 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  48.15 
 
 		 275 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  46.3 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  47.37 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  46.88 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.91 
 
 		 283 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 261 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.95 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  50 
 
 		 333 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.83 
 
 		 274 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.83 
 
 		 274 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  40.35 
 
 		 263 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  57.45 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 267 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  50 
 
 		 265 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  47.46 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  42.62 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  47.46 
 
 		 266 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  41.67 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  41.18 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  47.46 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.18 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  50.77 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.76 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 256 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  49.23 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  49.12 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.89 
 
 		 290 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.55 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  57.78 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  43.86 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.55 
 
 		 335 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  37.14 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1254  ABC transporter related  41.18 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00814045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  43.84 
 
 		 259 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  44.62 
 
 		 261 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4515  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.483028  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  50 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  48.98 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  42.11 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.31 
 
 		 304 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  54.35 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  54.35 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  54.35 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  45.76 
 
 		 271 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  45.71 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1927  ABC transporter related  41.82 
 
 		 262 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  45.71 
 
 		 292 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  43.66 
 
 		 282 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  44.07 
 
 		 268 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>