34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2051 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2051  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
102 aa  193  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.710872  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1449  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.19 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0399378  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.88 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  55 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  47.83 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.88 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2568  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.06 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0859386  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2767  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.06 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000764187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1198  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.06 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0357317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2672  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.06 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000356712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  46.55 
 
 
222 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  46.55 
 
 
222 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  46.55 
 
 
222 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  46.55 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1763  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  52.38 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  44.83 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.89 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  33.33 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  40.68 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.27 
 
 
606 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  38.98 
 
 
81 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  52.54 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  45.61 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.68 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  30.16 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
122 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 
81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>