16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1817 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1817  hypothetical protein  100 
 
 
637 aa  1238    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  26.71 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  26.46 
 
 
480 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  27.16 
 
 
533 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  28.13 
 
 
476 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  23.75 
 
 
528 aa  57.4  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  20.18 
 
 
534 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  29.81 
 
 
561 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  38.46 
 
 
553 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  25.77 
 
 
589 aa  53.9  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  35.38 
 
 
553 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  25.75 
 
 
603 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  25.86 
 
 
583 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
383 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  24.37 
 
 
642 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0878  hypothetical protein  32.86 
 
 
561 aa  44.3  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.265899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>