More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1105 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1105  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0411288  decreased coverage  0.00144137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 233 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 244 aa  76.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 233 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  35.48 
 
 		 705 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  42.02 
 
 		 391 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  33.33 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  34.92 
 
 		 705 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0965  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 411 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.656429  normal  0.215977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 457 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.62 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  38.98 
 
 		 233 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 247 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 304 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 305 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.93 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  41.35 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  37.82 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  36.67 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  36.97 
 
 		 248 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  36.13 
 
 		 248 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  40.71 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0908  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  35.9 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  38.98 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>