More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0787 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
248 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  55.87 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  57.74 
 
 
238 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  55.42 
 
 
250 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  53.97 
 
 
249 aa  276  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  57.98 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 
248 aa  271  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  58.92 
 
 
253 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  57.61 
 
 
255 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  55 
 
 
252 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  59.58 
 
 
237 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  59.58 
 
 
237 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  59.58 
 
 
237 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  59.58 
 
 
237 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  59.58 
 
 
237 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
257 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  57.09 
 
 
253 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  55.24 
 
 
250 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  57.61 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  58.75 
 
 
237 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  55.33 
 
 
251 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  51.81 
 
 
259 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  58.4 
 
 
238 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  56.02 
 
 
250 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  58.37 
 
 
295 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  57.68 
 
 
245 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  56.5 
 
 
259 aa  258  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  55.56 
 
 
258 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 
523 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  52.42 
 
 
253 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  52.4 
 
 
523 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 
250 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  57.44 
 
 
238 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  54.66 
 
 
238 aa  256  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
250 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 
523 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
250 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
250 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
242 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  52 
 
 
523 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  54.62 
 
 
518 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  51.04 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  52.74 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  55.92 
 
 
244 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  52.36 
 
 
239 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  59.05 
 
 
241 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  53.22 
 
 
241 aa  248  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  51.67 
 
 
522 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  50.81 
 
 
247 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  56.49 
 
 
255 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  52.05 
 
 
249 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  52.97 
 
 
518 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.71 
 
 
254 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  52.02 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  50.76 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  50.83 
 
 
522 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  60.82 
 
 
254 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  54.15 
 
 
529 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  51.27 
 
 
241 aa  244  8e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  52.54 
 
 
522 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  54.11 
 
 
518 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  48.54 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  52.19 
 
 
528 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  51.32 
 
 
529 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  55.51 
 
 
268 aa  241  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  52.63 
 
 
577 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  53.88 
 
 
255 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  53.2 
 
 
518 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  58.06 
 
 
253 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  58.06 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  49.8 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
514 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  51.61 
 
 
254 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  57.26 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
510 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  51.87 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  52.99 
 
 
530 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.38 
 
 
519 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  52.38 
 
 
519 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  51.87 
 
 
247 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.38 
 
 
519 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.38 
 
 
519 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  52.38 
 
 
519 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  55.74 
 
 
249 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  51.22 
 
 
248 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 
274 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
527 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  52.44 
 
 
515 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  54.51 
 
 
248 aa  236  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>