68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0339 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0339  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.834637  normal  0.0667006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2558  protein of unknown function DUF177  38.75 
 
 
179 aa  95.9  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0849  hypothetical protein  35.76 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  30.22 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  30.37 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000416974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  32.31 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  27.27 
 
 
172 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  29.58 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  29.58 
 
 
182 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  35.24 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  33.33 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  30.32 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  29.3 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  33.88 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  28.86 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  27.97 
 
 
157 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  28.81 
 
 
179 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  33.09 
 
 
192 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  28.04 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000607383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  28.57 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000072056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  34.55 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1576  hypothetical protein  34.72 
 
 
180 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000754833  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1039  putative metal-binding/nucleic acid-binding protein  28.33 
 
 
209 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  29.57 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  37.17 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  37.17 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  37.17 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0071  protein of unknown function DUF177  30 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0334  hypothetical protein  31.3 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1598  hypothetical protein  29.81 
 
 
179 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  29.91 
 
 
171 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  26.9 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  29.52 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1739  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000472305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  27.52 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000775006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1512  protein of unknown function DUF177  35.56 
 
 
173 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0835  hypothetical protein  28.07 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000635204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  26.89 
 
 
183 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  34.71 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1994  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  0.358979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  29.7 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1928  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  26.96 
 
 
131 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1948  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  29.7 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2426  hypothetical protein  28.78 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00706179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  27.84 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1881  protein of unknown function DUF177  28.28 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0908518  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  52.38 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1057  hypothetical protein  30.43 
 
 
139 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000225436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  26.21 
 
 
178 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1274  hypothetical protein  32.22 
 
 
147 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000334048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  27.74 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1085  metal-binding protein  32.22 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05650  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  27.46 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00861555  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  31.21 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  32.33 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2071  protein of unknown function DUF177  28.72 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.972003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  22.76 
 
 
166 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1411  protein of unknown function DUF177  31.01 
 
 
177 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  31.11 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  30.37 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0474  hypothetical protein  27.59 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000014524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0210  protein of unknown function DUF177  30.48 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  27.1 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  24.32 
 
 
186 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>