14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0022 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 		 595 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 596 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  37.68 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  35.16 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 		 572 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  32.26 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  37.31 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2250  hypothetical protein  30.39 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.478876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  30.93 
 
 		 239 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  29.79 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  31.87 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.33 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  31.67 
 
 		 569 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>