101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5386 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5386  metallophosphoesterase  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1191  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4178  cyclic AMP phosphodiesterase  27.09 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.45 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.45 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0581  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.78 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  23.4 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  25.21 
 
 
265 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2036  cyclic AMP phosphodiesterase  24.78 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.065067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  24.68 
 
 
266 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.7 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.71 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3445  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.78 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  25.48 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  29 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.7 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2339  metallophosphoesterase  24.78 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.81 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0071  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
274 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  24.7 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  26.94 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  25.24 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.1 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  27.19 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2085  cyclic AMP phosphodiesterase  24.08 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  25.95 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2672  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.02 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  24.07 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.21 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  24.32 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.72 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004519  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.1 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  24.41 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  25.68 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  22.63 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2010  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.45 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.72 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.72 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.72 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  23.72 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0277  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.55 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.55 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.55 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.55 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  23.55 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  23.61 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  23.29 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  26.03 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  24.32 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  25.47 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  26.27 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0586  hypothetical protein  26.86 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377667  hitchhiker  0.00798208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  26.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
312 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.2 
 
 
229 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  22.98 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02110  hypothetical protein  25.57 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  24.36 
 
 
364 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00872  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  27.94 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  26.69 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2149  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.62 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.46 
 
 
769 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.98 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03687  3,5-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.98 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00113636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  24.14 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2539  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1456  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
361 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  21.65 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0631  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.82 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  22.17 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  24.72 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>