109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5092 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5092  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000245151  normal  0.239892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1457  rhodanese domain-containing protein  53 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217864  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.98 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 353 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  32.98 
 
 		 355 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  33.75 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  31.91 
 
 		 355 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  31.91 
 
 		 355 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  32.98 
 
 		 355 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  31.91 
 
 		 339 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  31.11 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.19 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  28.89 
 
 		 346 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  29 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  30.86 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  29 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.62 
 
 		 348 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.14 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  31.37 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  30.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.5 
 
 		 548 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0058857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 548 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  28.42 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.06 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  41.27 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  27.47 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  32.14 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  35.53 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2756  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.5 
 
 		 548 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394023  normal  0.393296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  38.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.49 
 
 		 280 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.21 
 
 		 144 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  28.89 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  27.37 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.8 
 
 		 163 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  37.29 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  27.55 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  27.37 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  29.67 
 
 		 255 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.47 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  29.49 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.12 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.18 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  30.67 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.112795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  30 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0454  rhodanese-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 324 aa  40.8  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.622343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  46.55 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  36.25 
 
 		 554 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  36.25 
 
 		 554 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  36.25 
 
 		 554 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>