89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5085 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5085  FeoA family protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00192965  normal  0.334589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3725  ferrous iron transport protein A  64.86 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1450  FeoA family protein  58.67 
 
 
75 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298241  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  50.7 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  54.29 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  50.7 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  50 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  42.47 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  48.68 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  42.31 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  40.85 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1077  FeoA family protein  45.33 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  45.33 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  43.66 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  45.07 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  41.46 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  39.73 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  42.25 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  42.25 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  39.44 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  41.1 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  45.59 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  43.33 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  43.66 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  41.67 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  45.45 
 
 
79 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  41.67 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  42.47 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  40.58 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  38.89 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  42.25 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  35.62 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  37.5 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  50 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  50 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  41.67 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.44 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  42.03 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  42.19 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  40.58 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  45.1 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  34.72 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  40.58 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  36.62 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  37.5 
 
 
785 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  36.11 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  34.72 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0318  FeoA family protein  42.62 
 
 
75 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  36.11 
 
 
157 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  34.72 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  34.21 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  32.93 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  39.44 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  38.36 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  35.8 
 
 
784 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  41.43 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  45.83 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  35.21 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2659  FeoA family protein  34.25 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  41.67 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.44 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  36.99 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0883  Fe2+ transport system protein A  32.88 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000745699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  44.23 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  43.75 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  39.19 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  41.67 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  35.71 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5891  Fe2+ transport system protein A  36.84 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  33.77 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  38.89 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0965  FeoA family protein  39.68 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  39.22 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  36.36 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2435  FeoA family protein  41.51 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3949  FeoA family protein  35.21 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  38.24 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1160  FeoA family protein  36.36 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108627  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0674  FeoA family protein  41.67 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.548462  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4062  FeoA family protein  35.21 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  32.39 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1507  FeoA family protein  32.86 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.103375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  41.67 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 
829 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5430  hypothetical protein  35.14 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0013  FeoA family protein  30.43 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  35.21 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>