15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4485 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4485  putative oxidoreductase  100 
 
 		 461 aa  952    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0048  hypothetical protein  62.69 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883134  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1697  hypothetical protein  59.38 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.472344  normal  0.0751505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1024  hypothetical protein  56.82 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 327 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  25.66 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  26.26 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 699 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  22.94 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  23.23 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  21.86 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>