More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2024 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.53 
 
 		 182 aa  238  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  58.62 
 
 		 200 aa  224  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  53.98 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.15 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  55.43 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  51.72 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  51.72 
 
 		 184 aa  184  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  51.45 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.55 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.83 
 
 		 191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.51 
 
 		 191 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.57 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.05 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  43.45 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.42 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.26 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42.66 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.97 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.75 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.84 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.36 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.48 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  39.51 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  37.68 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.22 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.9 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.04 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  39.51 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  36.65 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 275 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 284 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.53 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  37.57 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.89 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.81 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  33.96 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  34.78 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.13 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  37.14 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  37.14 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  36.02 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.35 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  38.19 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  35.51 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.01 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  34.78 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  35.4 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  34.16 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  35.66 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  34.16 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  34.16 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  37.86 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  40.14 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  33.55 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.97 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  36.65 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  37.7 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  36.65 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  32.7 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  35.37 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.44 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  32.7 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.68 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  33.79 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.46 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  34.59 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  36.88 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>