87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0545 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  154  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.941544  normal  0.960974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1862  Protein of unknown function DUF2132  69.44 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.111787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0132  hypothetical protein  72.31 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00577165  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0628  hypothetical protein  60.56 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00226969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2444  hypothetical protein  65.67 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.035682  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3456  hypothetical protein  66.67 
 
 		 99 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.734318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1610  hypothetical protein  62.32 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0890  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2614  hypothetical protein  62.32 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1959  hypothetical protein  60.87 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.828133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03420  hypothetical protein  60.29 
 
 		 72 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2504  hypothetical protein  62.69 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  0.0140198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2434  hypothetical protein  62.69 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  hitchhiker  0.00140537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2596  hypothetical protein  63.64 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.362148  hitchhiker  0.00128631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2436  hypothetical protein  60.87 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00639773  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1277  hypothetical protein  61.19 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.302152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1449  hypothetical protein  68.18 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1318  hypothetical protein  56.34 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0378  hypothetical protein  61.19 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2827  hypothetical protein  62.12 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3651  hypothetical protein  67.19 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1255  hypothetical protein  59.7 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000449725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3149  hypothetical protein  58.46 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.895069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1546  hypothetical protein  62.12 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.819607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1084  hypothetical protein  57.14 
 
 		 73 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1251  hypothetical protein  61.9 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814081  normal  0.429328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3441  hypothetical protein  60.29 
 
 		 74 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1391  hypothetical protein  64.18 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06650  hypothetical protein  59.7 
 
 		 72 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6012  hypothetical protein  63.33 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3042  hypothetical protein  59.7 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.132627  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2029  hypothetical protein  61.54 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1619  hypothetical protein  54.67 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00951066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1656  hypothetical protein  63.08 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0143793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0593  hypothetical protein  62.69 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0923126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4358  hypothetical protein  52.78 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4258  hypothetical protein  55.71 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4274  hypothetical protein  52.78 
 
 		 73 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1693  hypothetical protein  63.08 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.010158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2687  hypothetical protein  63.08 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377481  hitchhiker  0.00029816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1422  hypothetical protein  62.12 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1671  hypothetical protein  62.12 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.191799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4356  hypothetical protein  55.88 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1447  hypothetical protein  54.29 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302055  normal  0.30283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00756  hypothetical protein  57.35 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2062  hypothetical protein  60.61 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000656524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3518  hypothetical protein  60.32 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1412  hypothetical protein  59.7 
 
 		 71 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50000  hypothetical protein  55.71 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0489266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1649  hypothetical protein  55.07 
 
 		 77 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.994214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3929  hypothetical protein  52.05 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2838  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2925  hypothetical protein  52.11 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1431  hypothetical protein  52.11 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2357  Protein of unknown function DUF2132  60.66 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414721  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0938  hypothetical protein  59.38 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.234325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4575  hypothetical protein  55.22 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1541  hypothetical protein  58.73 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.455929  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1416  hypothetical protein  57.58 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4195  hypothetical protein  52.78 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001137  hypothetical protein  56.92 
 
 		 72 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1023  hypothetical protein  60.32 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1359  hypothetical protein  63.49 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0341  Protein of unknown function DUF2132  58.06 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.051948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0089  hypothetical protein  53.73 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1066  hypothetical protein  56.45 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3339  hypothetical protein  58.73 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3622  hypothetical protein  56.45 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1279  hypothetical protein  56.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2243  hypothetical protein  55.07 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000173706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4218  hypothetical protein  53.23 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06613  hypothetical protein  50.75 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001497  hypothetical protein  50.75 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1743  hypothetical protein  52.24 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0618  hypothetical protein  50.75 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.58372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2951  hypothetical protein  56.45 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3084  hypothetical protein  54.84 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2352  hypothetical protein  47.76 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2123  hypothetical protein  47.76 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2109  hypothetical protein  46.27 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2236  hypothetical protein  46.27 
 
 		 197 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.664941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2116  hypothetical protein  46.27 
 
 		 166 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0234268  normal  0.096624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1749  hypothetical protein  47.76 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.286111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2372  hypothetical protein  47.76 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2280  hypothetical protein  43.28 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0770  hypothetical protein  40.3 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1877  hypothetical protein  48.48 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.033963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>