79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0411 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0411  proteasome-type protease  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2600  proteasome-type protease  75.83 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3460  proteasome-type protease  63.18 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0153952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2854  putative proteasome-type protease  61.41 
 
 		 245 aa  315  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0195772  normal  0.483271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1430  hypothetical protein  38.84 
 
 		 292 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0766  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4446  hypothetical protein  31.69 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1075  20S proteasome A and B subunits  31.56 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4514  hypothetical protein  31.17 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1155  20S proteasome, A and B subunits  31.56 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.15814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3913  20S proteasome, A and B subunits  33.74 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2843  hypothetical protein  32.66 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2273  proteasome-type protease-like protein  31.95 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0927551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3577  20S proteasome A and B subunits  32.92 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.852438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3590  20S proteasome A and B subunits  32.69 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2055  hypothetical protein  30.2 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0537  20S proteasome A and B subunits  30.83 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1943  20S proteasome A and B subunits  31.84 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3874  20S proteasome A and B subunits  29.75 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1358  20S proteasome, A and B subunits  32.41 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0361  20S proteasome A and B subunits  31.3 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2046  20S proteasome, A and B subunits  31.12 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1310  20S proteasome, A and B subunits  30.77 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.415114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2491  putative proteasome-type protease  31.95 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2172  20S proteasome A and B subunits  31.54 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3245  putative proteasome-type protease  31.73 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.716596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2215  putative proteasome-type protease  31.95 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.026686  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1831  hypothetical protein  32.38 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2679  20S proteasome, A and B subunits  34.3 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123152  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0009  20S proteasome, A and B subunits  30.29 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1050  putative proteasome-type protease  29.75 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1224  20S proteasome A and B subunits  29.63 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.716192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0401  20S proteasome, A and B subunits  30.99 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3338  20S proteasome, A and B subunits  30.98 
 
 		 286 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5276  hypothetical protein  29.39 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0581  putative proteasome-type protease  28.92 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6767  putative proteasome-type protease  30.77 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1180  hypothetical protein  30.61 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.545681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1086  hypothetical protein  30.86 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3163  putative proteasome-type protease  29.46 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3790  20S proteasome A and B subunits  30.49 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3527  20S proteasome A and B subunits  31.84 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0826  20S proteasome, A and B subunits  32.86 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.260877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7514  putative proteasome-type protease  30.36 
 
 		 250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.183506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2468  20S proteasome A and B subunits  28.63 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1035  putative proteasome-type protease  30.4 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.375974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1124  hypothetical protein  28.74 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.236863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2564  putative proteasome-type protease  27.27 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1063  hypothetical protein  28.09 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2237  putative proteasome-type protease  28.81 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3219  putative proteasome-type protease  29.22 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262147  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1255  20S proteasome A and B subunits  27.27 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1812  20S proteasome, A and B subunits  30.29 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0967  hypothetical protein  28.69 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0496453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2420  hypothetical protein  30.45 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1081  20S proteasome, A and B subunits  30.45 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1564  20S proteasome, A and B subunits  31.28 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268421  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2117  20S proteasome, A and B subunits  29.96 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.434254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2772  20S proteasome, A and B subunits  28.98 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1405  20S proteasome, A and B subunits  30.33 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0772  20S proteasome, A and B subunits  28.33 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.546228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1017  hypothetical protein  26.86 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3109  putative proteasome-type protease  28.03 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3573  hypothetical protein  27.2 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1674  20S proteasome A and B subunits  25.62 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3014  putative proteasome-type protease  27.87 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42130  hypothetical protein  26.78 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2685  hypothetical protein  26.36 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3068  proteasome-type protease-like protein  26.36 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2086  hypothetical protein  28.22 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000418459  hitchhiker  0.00675376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0305  20S proteasome, A and B subunits  27.31 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3432  20S proteasome A and B subunits  27.62 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182468  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3877  hypothetical protein  28.15 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2903  hypothetical protein  25.21 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2521  20S proteasome, A and B subunits  25.21 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  23.44 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  23.44 
 
 		 921 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  23.44 
 
 		 921 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>