147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0090 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0090  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  40.58 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  40.58 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 225 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  34.18 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 238 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  34.18 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  34.18 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  34.29 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  33.03 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  35.53 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4229  single-strand binding protein  32 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.0453464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 236 aa  47.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  26.32 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  32.35 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  29.73 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  31.94 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  31.37 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  31.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.2 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 233 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  27.96 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30.49 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  35.62 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  32.88 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.92 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.47 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  32.47 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  32.61 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  30 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  25.96 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  26.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  41.54 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.62 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  41.54 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  41.54 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  29.76 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  29.76 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  27.83 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  34.25 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  34.25 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  29.31 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  29.76 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 183 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  28 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  35.62 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.34 
 
 		 166 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  35.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>