More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2247 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2247  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
436 aa  877    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.353036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  61.7 
 
 
395 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  59.61 
 
 
380 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  57.39 
 
 
379 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  54.73 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  49.03 
 
 
384 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 
373 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
376 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.34 
 
 
372 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  41.25 
 
 
376 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.54 
 
 
390 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  43.81 
 
 
383 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
373 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  44.04 
 
 
377 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  40.3 
 
 
392 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  38.46 
 
 
372 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  41.37 
 
 
367 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  44.61 
 
 
374 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  42.61 
 
 
373 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
373 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  39.7 
 
 
373 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  40.81 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  42.97 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  42 
 
 
376 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  40.36 
 
 
393 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40.41 
 
 
387 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  41.1 
 
 
376 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  40.3 
 
 
378 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  42.46 
 
 
374 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.04 
 
 
372 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  38.62 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  43.58 
 
 
372 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  37.08 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  39.75 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  42.53 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  42.53 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  39.44 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  41.81 
 
 
372 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  38.99 
 
 
373 aa  243  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  41.52 
 
 
371 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  42.05 
 
 
374 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  39.25 
 
 
376 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  41.35 
 
 
372 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  40 
 
 
393 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  39.25 
 
 
376 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  42.24 
 
 
368 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  39.03 
 
 
367 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.23 
 
 
373 aa  240  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  41.65 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.31 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  40.81 
 
 
369 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  41.52 
 
 
375 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  41.06 
 
 
372 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  39.69 
 
 
370 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  38.48 
 
 
373 aa  237  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  41.31 
 
 
372 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  41.27 
 
 
374 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  43.69 
 
 
372 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
372 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  42.16 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  40.05 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  41.56 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  43 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  40.31 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  43.08 
 
 
372 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  39.8 
 
 
382 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  41.39 
 
 
372 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
372 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  41.39 
 
 
372 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  41.39 
 
 
372 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  41.1 
 
 
384 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 
369 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
372 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 
367 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  39.24 
 
 
367 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  38.99 
 
 
367 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
372 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  39.09 
 
 
386 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  38.73 
 
 
369 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
372 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  38.73 
 
 
369 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
372 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  38.83 
 
 
414 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  38.99 
 
 
386 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  39.09 
 
 
367 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  37.03 
 
 
367 aa  229  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  38.99 
 
 
367 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
372 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  41.1 
 
 
377 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>