86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1458 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2580  deoxyribonuclease I  53.36 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  52.65 
 
 
250 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  52.59 
 
 
243 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  52.59 
 
 
243 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  51.65 
 
 
243 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  42.99 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  41.15 
 
 
231 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  38.31 
 
 
231 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  41.84 
 
 
233 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  41.8 
 
 
232 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  40.72 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0839  endonuclease I  42.99 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0841  deoxyribonuclease I  42.99 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000239428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3345  endonuclease I  42.99 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  41.52 
 
 
237 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  39.68 
 
 
232 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  39.84 
 
 
232 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  41.86 
 
 
229 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  42.23 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  42.23 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  42.23 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  42.23 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  42.23 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  41.75 
 
 
235 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  39.06 
 
 
235 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  41.75 
 
 
235 aa  151  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  41.75 
 
 
235 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  41.75 
 
 
235 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  40.72 
 
 
235 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  40.72 
 
 
235 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  40.72 
 
 
235 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  40.72 
 
 
235 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  40.72 
 
 
235 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  38.5 
 
 
257 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  38.5 
 
 
258 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  40 
 
 
243 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  40.93 
 
 
229 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  38.05 
 
 
257 aa  148  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  38.05 
 
 
257 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  37.45 
 
 
269 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  36.73 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  40.69 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  36.61 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  37.39 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  38.29 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  40.69 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  40.2 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  39.71 
 
 
259 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0544  deoxyribonuclease I  38.33 
 
 
254 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3521  deoxyribonuclease I  36.55 
 
 
230 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.271071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  35.22 
 
 
321 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  35.22 
 
 
321 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  35.63 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3242  deoxyribonuclease I  36.14 
 
 
230 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.187326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2451  deoxyribonuclease I  36.55 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  35.25 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  34.01 
 
 
323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2148  deoxyribonuclease I  35.81 
 
 
233 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000104352  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2364  endonuclease I  35.12 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  36.29 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  36.29 
 
 
237 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  33.47 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  35.24 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  36.07 
 
 
231 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  37.16 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  34.67 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  34.67 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0256  extracellular deoxyribonuclease  31.28 
 
 
223 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  24.38 
 
 
232 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  33.57 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  30.89 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  28.67 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  30.82 
 
 
614 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  28.57 
 
 
617 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  29.84 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  25.83 
 
 
538 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  26.43 
 
 
539 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  29.23 
 
 
1310 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  26.49 
 
 
539 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  28.57 
 
 
308 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  40.98 
 
 
341 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  26.09 
 
 
558 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  26.09 
 
 
558 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  24.32 
 
 
365 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  25.55 
 
 
267 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>