108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1350 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1350  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 470 aa  951    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0181784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0976  hypothetical protein  44.77 
 
 		 203 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000617061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0933  hypothetical protein  34.02 
 
 		 197 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 751 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.2 
 
 		 767 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3311  hypothetical protein  31.22 
 
 		 205 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000479658  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0391  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  87  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.85 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 		 1424 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 843 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 885 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1215 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30 
 
 		 1328 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 1186 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.13 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 771 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 924 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0170  hypothetical protein  32.96 
 
 		 169 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.319575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 787 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1105 aa  73.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 911 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.35 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1039 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 		 919 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 1050 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 991 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 1288 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 1507 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 1262 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0389  hypothetical protein  31.22 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.642926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.39 
 
 		 822 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.34 
 
 		 1131 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 814 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23 
 
 		 2145 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 953 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  26.78 
 
 		 680 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 1128 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 190 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  27.4 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.5 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.55 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.73 
 
 		 799 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1774  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.772878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.18 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  27.78 
 
 		 977 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1212 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.29 
 
 		 1044 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1550 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  19.29 
 
 		 1404 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 1185 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 		 1475 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.29 
 
 		 694 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 782 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 640 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 162 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 		 1136 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.66 
 
 		 2413 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  20.33 
 
 		 809 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.27 
 
 		 1488 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1313 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.73 
 
 		 836 aa  50.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.4 
 
 		 957 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1261 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.64 
 
 		 854 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.33 
 
 		 985 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 1290 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 1054 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1101 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.71 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0390  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 591 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.5 
 
 		 919 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1451 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  28.29 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 669 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1454 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 828 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.04 
 
 		 1228 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 		 665 aa  46.6  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.83 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  20.15 
 
 		 1009 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 966 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 667 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>