More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1152 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  927    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  69.04 
 
 
450 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  66.15 
 
 
450 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  67.48 
 
 
450 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  64.43 
 
 
452 aa  607  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2189  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  67.29 
 
 
451 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  64.21 
 
 
452 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  64.37 
 
 
450 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  64.88 
 
 
450 aa  594  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  63.62 
 
 
449 aa  585  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  62.58 
 
 
443 aa  586  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  61.52 
 
 
455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1557  glutamate dehydrogenase  63.53 
 
 
454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  61.69 
 
 
443 aa  580  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  60.58 
 
 
443 aa  574  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0345  glutamate dehydrogenase  62.5 
 
 
453 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  63.7 
 
 
444 aa  568  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  60.53 
 
 
466 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  61.28 
 
 
445 aa  566  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  60.94 
 
 
448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  61.64 
 
 
451 aa  564  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  59.82 
 
 
448 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  59.6 
 
 
448 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  60.22 
 
 
444 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  59.42 
 
 
451 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  60.89 
 
 
447 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  61.02 
 
 
445 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  61.25 
 
 
448 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  58.89 
 
 
445 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  60.22 
 
 
444 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  61.02 
 
 
449 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  60.8 
 
 
449 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  61.25 
 
 
449 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  62.36 
 
 
449 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  57.02 
 
 
454 aa  544  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 
448 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  60.4 
 
 
449 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  58.59 
 
 
452 aa  531  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  58.61 
 
 
449 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  60.47 
 
 
449 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  61.66 
 
 
444 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  60.74 
 
 
447 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  61.16 
 
 
450 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  56.1 
 
 
450 aa  530  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  60.23 
 
 
449 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  60.7 
 
 
450 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  58.39 
 
 
445 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  61.43 
 
 
449 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  61.2 
 
 
446 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  61.4 
 
 
449 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 
448 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  58.1 
 
 
450 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 
448 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 
448 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  59.58 
 
 
449 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.48 
 
 
446 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  57.49 
 
 
445 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  58.35 
 
 
445 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  56.57 
 
 
446 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  58.13 
 
 
445 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.35 
 
 
445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  57.24 
 
 
449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  57.46 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  57.24 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  59.26 
 
 
447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  58.22 
 
 
449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  58.66 
 
 
447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  60 
 
 
458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  57.81 
 
 
447 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  57.43 
 
 
447 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.39 
 
 
445 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  59.53 
 
 
451 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  59.95 
 
 
453 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  56.82 
 
 
451 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  59.58 
 
 
445 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  57.49 
 
 
449 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  56.38 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  59.58 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  57.01 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4692  glutamate dehydrogenase  56.35 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  56.79 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  58.89 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  56.63 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  57.7 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  54.87 
 
 
451 aa  501  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.66 
 
 
449 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4036  glutamate dehydrogenase  55.85 
 
 
447 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0119  glutamate dehydrogenase  55.85 
 
 
447 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4089  glutamate dehydrogenase  55.85 
 
 
447 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  56.78 
 
 
447 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  55.61 
 
 
447 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  54.93 
 
 
447 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04440  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 
446 aa  495  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  54.85 
 
 
449 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  54.93 
 
 
447 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  55.61 
 
 
447 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  55.61 
 
 
447 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  55.61 
 
 
447 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  54.93 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>