More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0560 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0560  iojap-like protein  100 
 
 
143 aa  296  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1517  iojap-like protein  51.22 
 
 
134 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0831178  hitchhiker  0.0026713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0440  iojap-like protein  52.78 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  49.07 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1140  iojap-like protein  49.51 
 
 
130 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000105704  normal  0.940401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  37.39 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  35.94 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  37.17 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  35.94 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  40.22 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  42.71 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  42.71 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  38.46 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  38.46 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  39.36 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  42 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  37.36 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  42.86 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  34.31 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  42.05 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  34.31 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  35.77 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  35.71 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  39.13 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  35.85 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  34.58 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.59 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  38.83 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  35.29 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  33.33 
 
 
164 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  38.46 
 
 
226 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  36.46 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  37.76 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  36.19 
 
 
120 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  37.11 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  40.22 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  39.13 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  35.87 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  41.57 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  39.13 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  38.95 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  39.13 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  30.77 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  38.46 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  36.96 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  37.36 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  36.27 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  38.64 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  38.64 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  38.46 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  37.36 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  35.87 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  37.62 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  36.96 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  37.36 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  39.13 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  37.36 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  41.3 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  38.46 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  34.38 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  31.37 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  33.66 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  34 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  35.16 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  37.5 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  31.37 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  38.04 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  35.05 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  38.2 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  35.24 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  36.17 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0919  iojap-related protein  45.59 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  34.74 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  37.36 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  34.82 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  35.51 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  37.5 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  39.33 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  39.33 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  30.91 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  34.95 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  36.26 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  31.78 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>