16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1612 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  998    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0513  putative PAS/PAC sensor protein  50.37 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0162145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0922  hypothetical protein  29.98 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.159018  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3145  hypothetical protein  27.87 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000246792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1718  hypothetical protein  27.56 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 1267 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 1211 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 720 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1131 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 705 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 729 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1113 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 902 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 1465 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.09 
 
 		 960 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  23 
 
 		 1561 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>