68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1311 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1311  peroxiredoxin-like  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000122342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2815  redoxin domain-containing protein  32.24 
 
 
214 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  32.58 
 
 
223 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.12 
 
 
223 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.78 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5164  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.03 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  28.97 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5154  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.26 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3516  AhpC/Tsa family protein, selenocysteine-containing  32.08 
 
 
230 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000205583  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5154  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.09 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176313  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1235  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.28 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000509525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0066  AhpC/Tsa family protein, selenocysteine-containing  31.13 
 
 
235 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.77 
 
 
226 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0709659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5141  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.98 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301686  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.18 
 
 
219 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0336398  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5433  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.64 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2997  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.14 
 
 
218 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1755  redoxin  27.78 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0124  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 
217 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.490683  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0231094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5324  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.32 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236507  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.97 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  24.57 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.43 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.43 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.43 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.43 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  23.17 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  23.17 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.91 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  24.57 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  24.84 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  23.64 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.79 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  22.56 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.58 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  22.42 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.48 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.79 
 
 
221 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000652947  decreased coverage  0.000228018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.55 
 
 
282 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3093  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
152 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1677  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.38 
 
 
159 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2315  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.21 
 
 
184 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0863049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21880  peroxiredoxin, thioredoxin-like fold protein  24.66 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2669  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  28.85 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  25.64 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  30.69 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2342  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0931476  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2414  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.179933  hitchhiker  0.00423315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1654  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.115351  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2592  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000187861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.96 
 
 
151 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000223575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1790  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591995  hitchhiker  0.00000000118266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1839  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.5 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2554  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4115  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
376 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  0.124097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1877  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.88 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1402  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.26 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0759  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.44 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.631395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  28.4 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2683  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.24 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.399218  normal  0.169075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.98 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.144324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3671  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.12 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1700  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  26 
 
 
155 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  20.38 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2365  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.6 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>