More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2937 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2937  diguanylate cyclase  100 
 
 
241 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3128  diguanylate cyclase  82.2 
 
 
241 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0981  diguanylate cyclase  70.94 
 
 
235 aa  349  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3329  diguanylate cyclase  69.66 
 
 
235 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2262  diguanylate cyclase  47.81 
 
 
237 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0475991  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3037  diguanylate cyclase  47.6 
 
 
246 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.470053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2926  diguanylate cyclase  49.13 
 
 
250 aa  207  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5582  diguanylate cyclase  46.96 
 
 
241 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503288  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1435  diguanylate cyclase  40.52 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0233  diguanylate cyclase  43.68 
 
 
373 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0312  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.77 
 
 
454 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  39.33 
 
 
301 aa  121  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  41.57 
 
 
532 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  39.77 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
532 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0421  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0440  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0482  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0422  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
370 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0427  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
370 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  36.4 
 
 
355 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  39.33 
 
 
474 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7783  diguanylate cyclase  38.14 
 
 
592 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  41.04 
 
 
753 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1693  diguanylate cyclase  38.55 
 
 
564 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000442745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2732  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  38.55 
 
 
564 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000132125  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1230  diguanylate cyclase  38.55 
 
 
558 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3863  diguanylate cyclase  37.1 
 
 
426 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0137114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  38.41 
 
 
371 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  38.41 
 
 
371 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
371 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  38.41 
 
 
371 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  43.2 
 
 
360 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
371 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  38.12 
 
 
355 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1687  diguanylate cyclase  37.99 
 
 
564 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0356503  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0856  diguanylate cyclase AdrA  39.63 
 
 
371 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0674918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  39.64 
 
 
388 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  38.41 
 
 
371 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
600 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  34.65 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3988  two component response regulator  37.7 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  39.33 
 
 
451 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0302  diguanylate cyclase AdrA  37.8 
 
 
366 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  38.64 
 
 
629 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  37.08 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1077  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  37.99 
 
 
558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0412  diguanylate cyclase AdrA  37.8 
 
 
371 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0453  diguanylate cyclase AdrA  37.8 
 
 
371 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  38.17 
 
 
301 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0513  GGDEF domain-containing protein  37.71 
 
 
426 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2546  diguanylate cyclase  40.22 
 
 
564 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0032266  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.95 
 
 
730 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  38.64 
 
 
673 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  36.73 
 
 
448 aa  111  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  34.97 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
486 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.56 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
486 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
486 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
486 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  39.01 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
423 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2587  GGDEF domain-containing protein  34.25 
 
 
621 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  39.29 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2187  diguanylate cyclase  37.43 
 
 
558 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.55 
 
 
415 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2626  diguanylate cyclase  38.1 
 
 
591 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0100044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50060  hypothetical protein  44.19 
 
 
398 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  39.77 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  41.07 
 
 
696 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1057  GGDEF domain-containing protein  37.43 
 
 
264 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2150  cellulose synthesis regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297138  normal  0.0131316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
427 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  40.91 
 
 
479 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0939  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.01 
 
 
438 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.63 
 
 
917 aa  108  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2204  cellulose synthesis regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315572  normal  0.912149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
377 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1132  cellulose synthesis regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1253  cellulose synthesis regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.839594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  36.96 
 
 
432 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2146  cellulose synthesis regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.256949  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.95 
 
 
791 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3061  GGDEF domain-containing protein  35.36 
 
 
469 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  39.57 
 
 
462 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3837  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
452 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0314898  normal  0.0363493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0173  diguanylate cyclase  32.39 
 
 
339 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1471  diguanylate cyclase  40.99 
 
 
398 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0238873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  35.68 
 
 
349 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1128  diguanylate cyclase  35.64 
 
 
563 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716574  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  37.95 
 
 
359 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  32.5 
 
 
355 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
380 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  35.75 
 
 
464 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  41.21 
 
 
417 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.68 
 
 
309 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  34.31 
 
 
990 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  39.63 
 
 
653 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>