20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2776 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  229  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  80.53 
 
 
113 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  70.18 
 
 
114 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  67.54 
 
 
114 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  53.1 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  47.27 
 
 
133 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  46.79 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  45.87 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  36.27 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  36.27 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  33.04 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  51.02 
 
 
73 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  37.11 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  28.12 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  40.3 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  32.65 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>