131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2646 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2646  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
226 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.113769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1336  peptidase S14, ClpP  37.02 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151699  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  41.79 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.72 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0784  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.7 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  42.25 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01350  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
260 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00166627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1411  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.75 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15131  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.75 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15001  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.75 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14751  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.25 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.78 
 
 
205 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4545  endopeptidase Clp  22.67 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843015  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.19 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.78 
 
 
203 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1792  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.69 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0851453  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0185  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.06 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0223  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.06 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0202  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.06 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.06 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0017  endopeptidase Clp  36.99 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2322  endopeptidase Clp  36.11 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  36 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.39 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2507  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.51 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2679  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.03 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  36 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13621  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.75 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0830261  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2416  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.03 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.3 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  37.68 
 
 
203 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2371  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.03 
 
 
208 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2301  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.47 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1549  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.5 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.296057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0840  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.29 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.811715  hitchhiker  0.00939678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  37.68 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  30.84 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.43 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1781  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.06 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  32.71 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5134  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.39 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  38.03 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.13 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  38.03 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  36 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  24.81 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2166  Endopeptidase Clp  28.57 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1692  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  39.53 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15385  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  40.58 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0468078  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1855  Endopeptidase Clp  38.82 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.726179  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1915  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.23 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3662  endopeptidase Clp  28.57 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0017  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.67 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1476  endopeptidase Clp  28.57 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219391  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  39.44 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1212  Endopeptidase Clp  34.25 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  24.67 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4364  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  37.68 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.375461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7405  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.52 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1048  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000032499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.17 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1499  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.67 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3264  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.30385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1272  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.48 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.48 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  35.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.23 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0970  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.05 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000101618  normal  0.051864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.39 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  34.67 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.69 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1794  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.94 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.12 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0943  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.05 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.23 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.64318e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  36.23 
 
 
202 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2894  endopeptidase Clp  29.86 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421191  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1183  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  41.1 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.179836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  33.8 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.5 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.71 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.650112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.48 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3232  endopeptidase Clp  34.29 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.86752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0473  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3195  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000375799  hitchhiker  0.000337967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0360  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.93543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00392  hypothetical protein  33.65 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.12461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  34.67 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0488  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.65 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000119673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0490  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.65 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00691281  normal  0.831328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2392  endopeptidase Clp  29.93 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1337  hypothetical protein  28.42 
 
 
143 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0088932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>