45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1647 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  73.22 
 
 
184 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  66.27 
 
 
195 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  67.07 
 
 
195 aa  227  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  63.1 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  57.4 
 
 
180 aa  203  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000043428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  203  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000720846  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  203  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000222204  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  203  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000481867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  57.4 
 
 
192 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000438094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000798367  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  57.4 
 
 
192 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000404596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  57.4 
 
 
192 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000152866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000278688  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000020025  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  57.4 
 
 
180 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  56.8 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000982581  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  56.21 
 
 
183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  56.21 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  56.21 
 
 
183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  55.62 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  40.96 
 
 
180 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  40.96 
 
 
180 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  39.41 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  38.55 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  34.5 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000237995  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  35.09 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  32.2 
 
 
179 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  32.56 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  34.09 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  29.82 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  29.82 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  29.89 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000237237  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  29.24 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  30.06 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  29.48 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  29.24 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  29.48 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  29.82 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  29.48 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  28.4 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>