More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_R0014 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_t00002  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00307219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00060  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0512928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00072  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00430225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0076  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000601074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0214  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000452405  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4463  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0383227  hitchhiker  0.000721732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00682305  normal  0.0131839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0215  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00974156  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4703  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4376  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221673  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4122  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000949102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4459  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00362002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000639755  hitchhiker  0.000460021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4269  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00650641  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0095  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0436248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4376  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000605236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4197  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0213106  normal  0.765485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4345  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0446638  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4599  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000253863  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00495936  normal  0.0650768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5292  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000452405  normal  0.257864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0089  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000026686  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0118  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000597046  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3572  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000440761  normal  0.421667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0197  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000401396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0274  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00335921  normal  0.424376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0078  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00023262  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4220  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00471797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4642  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000860884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5005  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4715  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5093  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000403795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5076  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000555714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0093  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.548376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0096  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4540  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0026423  hitchhiker  0.00000000000427901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4316  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0676327  normal  0.201068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0279  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106788  normal  0.58807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0293  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000102262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0274  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119216  normal  0.944216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0290  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0570234  normal  0.459614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0023212  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000443957  unclonable  0.00000686591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0311944  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0008  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000976028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0156  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223913  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0174  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0009  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0009  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0330321  hitchhiker  0.00801031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0148  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0080  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00215161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0021  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0879619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0052  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00660859  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0012  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133641  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0037  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0515316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna040  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0092  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.892072  normal  0.128947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0026  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0505593  unclonable  0.00000400099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0097  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.636111  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0159  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0561625  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0051  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000604865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0044  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000111435  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna080  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0703705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna156  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0009  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.306257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0022  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000187329  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0083  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00420307  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna032  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00431458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0003  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0369112  normal  0.119668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0071  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000469836  normal  0.108632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t053  tRNA-Ala  98.67 
 
 
76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0138736  hitchhiker  0.000000229903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t051  tRNA-Ala  98.67 
 
 
76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0611091  hitchhiker  0.0000203844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t008  tRNA-Ala  98.67 
 
 
76 bp  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.109166  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3112t  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3076t  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00255258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3088t  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>