17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2235 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2235  protein of unknown function DUF1555  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0504699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2231  protein of unknown function DUF1555  67.8 
 
 
263 aa  334  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2507  hypothetical protein  36.57 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3077  hypothetical protein  32.36 
 
 
288 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0321099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2510  hypothetical protein  32.83 
 
 
262 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000239713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2509  hypothetical protein  31.37 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000335843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0694  protein of unknown function DUF1555  31.5 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0693  protein of unknown function DUF1555  30.22 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0404  hypothetical protein  31.05 
 
 
293 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3076  hypothetical protein  27.64 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2746  hypothetical protein  25.51 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2434  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1766  hypothetical protein  48.65 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1994  hypothetical protein  66.67 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2481  protein of unknown function DUF1555  47.37 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2561  hypothetical protein  42 
 
 
169 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000942752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2085  hypothetical protein  62.07 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>