More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2153 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2153  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.779112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.41 
 
 
284 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.65 
 
 
273 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  35.18 
 
 
272 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.66 
 
 
282 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  35.38 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.2 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  37.82 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.1 
 
 
264 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.84 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2316  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.68 
 
 
279 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  38.36 
 
 
272 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2093  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.8 
 
 
275 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.269505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.16 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.75 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1679  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.02 
 
 
226 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  32.88 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  32.58 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.81 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.54 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.32 
 
 
216 aa  109  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.06 
 
 
249 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.3 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2459  thiF protein, putative  39.27 
 
 
284 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2835  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.34 
 
 
278 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.71 
 
 
255 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.49 
 
 
237 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.74 
 
 
255 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.74 
 
 
255 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.71 
 
 
255 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.8 
 
 
294 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.05 
 
 
252 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 
277 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.05 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.45 
 
 
243 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.15 
 
 
244 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.88 
 
 
249 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.89 
 
 
251 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.89 
 
 
251 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.48 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.97 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  33.05 
 
 
258 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.63 
 
 
249 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.19 
 
 
379 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  33.19 
 
 
252 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 
275 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.3 
 
 
255 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30 
 
 
256 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.87 
 
 
255 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.44 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.96 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.62 
 
 
443 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.33 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  32.24 
 
 
252 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.8 
 
 
348 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.68 
 
 
247 aa  99  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.48 
 
 
241 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.76 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.76 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  32.88 
 
 
368 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32 
 
 
389 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.88 
 
 
368 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.7 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.96 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.49 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  31.31 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.88 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.84 
 
 
348 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.64 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  32.84 
 
 
349 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.34 
 
 
253 aa  95.5  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.44 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  32.47 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.63 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.3 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  35.32 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.63 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.47 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  31.31 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.87 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0187  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.6 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.635564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.17 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.54 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.6 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  31 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.88 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.04 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.74 
 
 
253 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.63 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>