More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1343 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 663 aa  1324    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  53.97 
 
 		 668 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  53.88 
 
 		 678 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  51.12 
 
 		 685 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  49.34 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  46.27 
 
 		 658 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.45 
 
 		 886 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  42.57 
 
 		 845 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  42.24 
 
 		 833 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  41.09 
 
 		 923 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  42.5 
 
 		 844 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  43.49 
 
 		 859 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  40.79 
 
 		 914 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  40.79 
 
 		 914 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  39.85 
 
 		 912 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  43.22 
 
 		 787 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  41.09 
 
 		 858 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  44.12 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 864 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  39.74 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  40.43 
 
 		 830 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  42.08 
 
 		 834 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  41.96 
 
 		 787 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 		 912 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  40.54 
 
 		 845 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  39.37 
 
 		 868 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  40.56 
 
 		 896 aa  429  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  41.36 
 
 		 838 aa  429  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  40.37 
 
 		 840 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  42.35 
 
 		 914 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  42.3 
 
 		 840 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2197  preprotein translocase subunit SecA  44.96 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 		 824 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  41.21 
 
 		 848 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  42.01 
 
 		 873 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  42.75 
 
 		 836 aa  425  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  41.52 
 
 		 868 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  40.06 
 
 		 909 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  38.35 
 
 		 862 aa  423  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  39.91 
 
 		 903 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  38.67 
 
 		 862 aa  422  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 914 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  40.81 
 
 		 837 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3262  preprotein translocase subunit SecA  41.42 
 
 		 797 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  39.75 
 
 		 897 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  39.72 
 
 		 908 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  40.25 
 
 		 968 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  40.35 
 
 		 871 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1563  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 662 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  39.24 
 
 		 910 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  41.79 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  39.55 
 
 		 962 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  40.06 
 
 		 962 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  39.76 
 
 		 962 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3049  preprotein translocase subunit SecA  43.64 
 
 		 787 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  40.25 
 
 		 955 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  39.54 
 
 		 912 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  39.4 
 
 		 908 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  39.56 
 
 		 908 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  41.77 
 
 		 909 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  40.21 
 
 		 903 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  40.35 
 
 		 871 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  39.28 
 
 		 858 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 		 910 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 911 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  42.55 
 
 		 842 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 901 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 901 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 901 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  38.47 
 
 		 853 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  40.81 
 
 		 837 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 901 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  40.87 
 
 		 896 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  39.67 
 
 		 896 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  41.13 
 
 		 902 aa  419  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  38.94 
 
 		 909 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 901 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  39.4 
 
 		 908 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  39.78 
 
 		 908 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  38.64 
 
 		 905 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 931 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 931 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 931 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 907 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 931 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  38.86 
 
 		 932 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  38.34 
 
 		 907 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  41.23 
 
 		 903 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  39.28 
 
 		 907 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  39.22 
 
 		 944 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  40.34 
 
 		 836 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  39.85 
 
 		 933 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 931 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 799 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  39.08 
 
 		 925 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  42.6 
 
 		 884 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>