178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0830 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0830  response regulator receiver protein  100 
 
 
455 aa  934    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  31.45 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.41 
 
 
453 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  29.19 
 
 
451 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  29.35 
 
 
451 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
453 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
566 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
1252 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 
991 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 
1056 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
305 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
1737 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
288 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
620 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  22.22 
 
 
620 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  20.89 
 
 
1252 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 
1056 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 
296 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
878 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 
988 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2010  hypothetical protein  20.74 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.97 
 
 
639 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 
810 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.94 
 
 
818 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 
297 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.32 
 
 
887 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 
297 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
762 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 
632 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 
597 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  25.39 
 
 
581 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 
566 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 
992 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 
1061 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 
909 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
249 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
265 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
685 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 
3145 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1858  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.68 
 
 
326 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
784 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 
828 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
714 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
615 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.58 
 
 
561 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.45 
 
 
708 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.55 
 
 
689 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1060 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 
1486 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
917 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.54 
 
 
725 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
602 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.43 
 
 
561 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  21 
 
 
827 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 
626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
605 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 
626 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
255 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 
614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 
614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
4079 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
297 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
297 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  20.9 
 
 
626 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.03 
 
 
1022 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
207 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
217 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
243 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
573 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
448 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 
3301 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
265 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.1 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
632 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  21.28 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.11 
 
 
816 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
522 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
750 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
480 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
446 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
458 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
3172 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.77 
 
 
586 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
395 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
428 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>