29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2726 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2726  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00442656  normal  0.0144375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3591  conserved hypothetical protein  38.67 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1827  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2617  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.597605  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1719  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00113382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3650  hypothetical protein  39.73 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00005  hypothetical protein  39.73 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00005  hypothetical protein  39.73 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0006  hypothetical protein  38.36 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0567  hypothetical protein  35.37 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2925  hypothetical protein  38.82 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1328  hypothetical protein  34.09 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0457315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1440  hypothetical protein  34.09 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.591275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2681  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3622  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.669652  normal  0.697764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02261  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2759  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02300  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2542  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234991  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1279  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.128459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1267  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.389303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3425  hypothetical protein  36.99 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0811  hypothetical protein  36.99 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0270674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3583  Protein of unknown function DUF2502  36.99 
 
 
140 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000921365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3414  hypothetical protein  40.98 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3767  hypothetical protein  33.98 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00933749  hitchhiker  0.00116407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3241  hypothetical protein  33.98 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0533756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0781  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4829  hypothetical protein  30.1 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>