More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2138 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2138  cysteine synthase  100 
 
 		 324 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166923  decreased coverage  0.0000932984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3639  cysteine synthase A  83.38 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0668301  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  78.12 
 
 		 324 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0552  cysteine synthase A  79.63 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2664  cysteine synthase  79.75 
 
 		 329 aa  490  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.211268  normal  0.363932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  74.22 
 
 		 324 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0562  cysteine synthase A  81.73 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2072  cysteine synthase A  77.6 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  71.29 
 
 		 317 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  71.11 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  72.29 
 
 		 316 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2251  cysteine synthase A  70.99 
 
 		 326 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.047552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3447  cysteine synthase A  72.76 
 
 		 322 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0942235  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2520  cysteine synthase A  70.09 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0776  cysteine synthase A  72.45 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000080483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3190  cysteine synthase A  71.52 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000841845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  69.69 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1318  cysteine synthase A  71.21 
 
 		 322 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000253577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  70.62 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1013  cysteine synthase A  72.45 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0386297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0489  cysteine synthase A  70 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000338281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3268  cysteine synthase A  72.14 
 
 		 322 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1429  cysteine synthase A  71.21 
 
 		 322 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000782911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  69.97 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02314  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000113698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1247  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000402338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02275  hypothetical protein  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2685  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0206306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2569  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00204709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1699  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.678055  hitchhiker  0.0000451627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1983  cysteine synthase A  70.79 
 
 		 317 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000049928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2689  cysteine synthase A  69.44 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3645  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00108358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000422758  decreased coverage  0.000025009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2574  cysteine synthase A  69.44 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000179096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02168  cysteine synthase A  69.94 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2549  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000853816  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2766  cysteine synthase A  70.06 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2370  cysteine synthase A  68.75 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2623  cysteine synthase A  69.44 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2663  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1500  cysteine synthase  69.06 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1567  cysteine synthase  68.75 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2764  cysteine synthase A  69.06 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776991  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1561  cysteine synthase  69.06 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2665  cysteine synthase A  69.44 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01309  cysteine synthase A  71.25 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2942  cysteine synthase A  69.14 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000452572  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1413  cysteine synthase  69.38 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2795  cysteine synthase A  69.14 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1996  cysteine synthase  70.38 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.13993  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1682  cysteine synthase A  69.16 
 
 		 322 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2468  cysteine synthase A  68.22 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0868534  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21201  O-acetylserine (thiol)-lyase A  69.72 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.872322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1508  cysteine synthase A  71.38 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3986  cysteine synthase A  68.52 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2520  cysteine synthase A  66.98 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2382  cysteine synthase A  68.85 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29110  cysteine synthase A  69.04 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3690  cysteine synthase A  70 
 
 		 323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4571  cysteine synthase A  68.75 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1583  cysteine synthase K/M:cysteine synthase A  67.9 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.615929  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2857  cysteine synthase A  69.16 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.493872  hitchhiker  0.000671545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1721  cysteine synthase A  67.6 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4092  cysteine synthase A  68.75 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2517  cysteine synthase A  70.25 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  64.22 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2438  cysteine synthase A  70.13 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3871  cysteine synthase A  68.75 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.674292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1318  cysteine synthase A  68.44 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32850  Cysteine synthase K/M:Cysteine synthase K  68.83 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3902  cysteine synthase A  67.28 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04051  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.88 
 
 		 328 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1741  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.16 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0664  cysteine synthase K/M/A  68.15 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04581  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.16 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04261  O-acetylserine (thiol)-lyase A  67.83 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0068  cysteine synthase A  65.72 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04681  O-acetylserine (thiol)-lyase A  67.83 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04571  O-acetylserine (thiol)-lyase A  68.15 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.754639  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0402  O-acetylserine (thiol)-lyase A  66.88 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1467  cysteine synthase  61.92 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  65.06 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.99 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  62.9 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.54 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  61.78 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.42 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.1 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.77 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.71 
 
 		 311 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  58.86 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.94 
 
 		 320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.39 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  58.23 
 
 		 310 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>