26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2130 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2130    100 
 
 		 387 bp  767    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000379777  decreased coverage  0.0000528625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  88.14 
 
 		 972 bp  61.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  88.46 
 
 		 1062 bp  56  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  84.51 
 
 		 1071 bp  54  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  86.44 
 
 		 990 bp  54  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  88.24 
 
 		 990 bp  54  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  88.24 
 
 		 1131 bp  54  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  87.04 
 
 		 1038 bp  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  92.11 
 
 		 1311 bp  52  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  90.24 
 
 		 1095 bp  50.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  85.96 
 
 		 1182 bp  50.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  85.71 
 
 		 1059 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.71 
 
 		 1086 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  88.64 
 
 		 1053 bp  48.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  85.71 
 
 		 1059 bp  48.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  93.55 
 
 		 1077 bp  46.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  87.23 
 
 		 1110 bp  46.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  84.13 
 
 		 1059 bp  46.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  88.37 
 
 		 1086 bp  46.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  93.55 
 
 		 1104 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  82.28 
 
 		 1056 bp  46.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  93.55 
 
 		 1104 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 1065 bp  46.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  93.55 
 
 		 1104 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  93.55 
 
 		 1104 bp  46.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  87.23 
 
 		 1089 bp  46.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>