30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2049 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2049  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2465  hypothetical protein  75.53 
 
 
100 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.705928  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34640  hypothetical protein  70.21 
 
 
98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2196  hypothetical protein  68.09 
 
 
96 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.250793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2128  hypothetical protein  66.32 
 
 
95 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70369  normal  0.722848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0837  hypothetical protein  68.48 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.05984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1935  hypothetical protein  64.52 
 
 
96 aa  136  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.157401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3831  hypothetical protein  67.02 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0747  hypothetical protein  67.39 
 
 
99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000864185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0644  hypothetical protein  67.39 
 
 
99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0602249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2247  hypothetical protein  62.64 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  decreased coverage  0.00677011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0420  hypothetical protein  64.04 
 
 
100 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.3293  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3836  hypothetical protein  56.52 
 
 
131 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.242387  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0973  hypothetical protein  59.34 
 
 
140 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0086355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0484  hypothetical protein  58.7 
 
 
93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0003  hypothetical protein  58.62 
 
 
120 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000143416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0141  hypothetical protein  57.47 
 
 
114 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0143  hypothetical protein  57.47 
 
 
114 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4283  hypothetical protein  54.95 
 
 
170 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4271  hypothetical protein  54.95 
 
 
119 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1981  hypothetical protein  54.35 
 
 
103 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.11308  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2143  hypothetical protein  68.12 
 
 
69 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00966347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2347  hypothetical protein  54.35 
 
 
103 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.307924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4293  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1968  hypothetical protein  52.27 
 
 
118 aa  100  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.426641  normal  0.147802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4140  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15960  hypothetical protein  57.47 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1762  hypothetical protein  52.81 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0762473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0347  hypothetical protein  52.69 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7257  hypothetical protein  36.23 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338582  normal  0.560667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>