105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1401 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1401  cytochrome c, class I  100 
 
 		 116 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.967818  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  60.58 
 
 		 202 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4085  cytochrome c, class I  73.75 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00138515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1438  cytochrome c, class I  60.36 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2736  cytochrome c, class I  62 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.015229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1337  cytochrome c class I  50.93 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4077  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  43.16 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  28.45 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  34.15 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  33 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  31.86 
 
 		 1143 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  35.19 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  34 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  34 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 249 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  35 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  35.29 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  28.28 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  36.47 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 800 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 131 aa  47.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  34.51 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 1151 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  36.63 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  32.1 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  27.5 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5197  putative cytochrome c  30.19 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00308424  normal  0.125409 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  27.5 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  35.59 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  29.21 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0559  cytochrome c551/c552  42.59 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.536891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1182 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  30 
 
 		 348 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  26.53 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  28.75 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  28.75 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  35 
 
 		 984 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  25.93 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 908 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  27.91 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1576  cytochrome c-551 precursor  30.97 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.233841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  25.84 
 
 		 344 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  28.83 
 
 		 941 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>