91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0229 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0229  GPR1/FUN34/YaaH family protein  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1743  hypothetical protein  45.32 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.37 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  45.37 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  44.88 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0383  GPR1/FUN34/YaaH family protein  39.6 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2501  GPR1/FUN34/YaaH family protein  41.18 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.07917e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1604  hypothetical protein  42.49 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00253793  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  27.08 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.56 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.56 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.32 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  25.81 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  26.74 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  24.08 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  24.08 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.25 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  24.08 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  27.89 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  25.27 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  24.61 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.91 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.04 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.65 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  24.86 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  24.19 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.06 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  25.38 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.76 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.89 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  23.24 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  26.94 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.93 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.87 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.33 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.19 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  21.08 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  26.53 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.78 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.92 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  24.37 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.66 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.9 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  23.91 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  27.83 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.52 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.29 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  20.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.49 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.58 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.62 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2859  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  30.08 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  26.42 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.16 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.12 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.6 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.5 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  23.16 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.54 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0187  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.480658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.78 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  21.35 
 
 		 189 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  21.35 
 
 		 189 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.47 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  21.35 
 
 		 189 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  21.35 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>