9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3377 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3377  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 586 aa  1206    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1769  hypothetical protein  55.28 
 
 		 581 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.109783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1969  hypothetical protein  55.6 
 
 		 581 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194533  normal  0.770466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0873  hypothetical protein  30.51 
 
 		 517 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  27.35 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  33.82 
 
 		 341 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  26.85 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>