29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2678 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.520237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  25.58 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  26.87 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5239  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  27.97 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  23.08 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  21.77 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  26.15 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  26.02 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0822  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.06 
 
 		 197 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.66 
 
 		 200 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  22.54 
 
 		 206 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  21.49 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.66 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.03 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  27.35 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  21.85 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  21.49 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  21.49 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  21.49 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  31.01 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  31.01 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  31.01 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  27.13 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  21.54 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  27.13 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>