53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1148 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  218  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  62.39 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  63.64 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  63.64 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  48.62 
 
 
107 aa  105  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  47.71 
 
 
98 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  44.55 
 
 
107 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  48.62 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3956  hypothetical protein  45.87 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  42.61 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  40.54 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  41.23 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  41.82 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  38.74 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  41.28 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  35.45 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  30.28 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  35.96 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  34.86 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  32.11 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  34.55 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  39.05 
 
 
107 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  39.05 
 
 
107 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  29.36 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  39.05 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  37.61 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  32.11 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  32.73 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  33.04 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  31.53 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  32.43 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  31.58 
 
 
99 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  30.28 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  27.43 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  30.28 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  25.69 
 
 
105 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  25.69 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  25.93 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  25.69 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  26.61 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>