More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET_tRNA-Met-3 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1097  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0066  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0931764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  93.65 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  90.79 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  91.55 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  89.61 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  89.61 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0045  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA11  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>